유전체육종가 (Genomic Breeding Value)

축산학
한 줄 정의: 전장 유전체의 SNP 마커 정보를 통계모형에 적용하여 산출한 육종가로, 표현형 기록 없이도 조기에 유전능력을 예측할 수 있는 지표.

쉽게 풀면

유전자 정보만으로 미리 계산해낸, 그 동물이 얼마나 우수한 유전자를 물려줄지 나타내는 값.

왜 중요한가

유전체 육종가는 수만 개의 DNA 마커 정보를 표현형과 결합해 산출한 육종가로, 자손 성적을 기다리지 않고 어린 개체의 유전 능력을 예측할 수 있어 세대 간격을 크게 줄였습니다. 젖소 개량에서 종모우 선발 방식을 바꾼 핵심 기술이며, 한우·돼지·닭에서도 도입되어 예측 정확도 향상, 참조 집단 구성, 저밀도 칩 활용이 연구 주제입니다.

논문에서는 이렇게 쓰입니다

유전체육종가의 예측정확도는 참조집단 크기가 커질수록 향상되는 것으로 나타났다.

유전체 육종가를 예측할 때 비교 대상이 되는 데이터(참조집단)가 많을수록 예측이 더 정확해진다는 연구 결과이다.

"이 종축의 유전능력은 개체 자신의 표현형 기록 없이도 유전체육종가로 조기에 추정되었다."

유전체육종가는 개체 자신의 표현형 측정을 기다리지 않고 참조집단 정보와 유전체 정보를 이용해 개체의 육종가를 추정하는 값으로, 전통적 혈통 기반 육종가보다 세대 간격을 단축할 수 있어 축산 육종 연구에서 선발 효율을 높이는 데 쓰인다.

조금 더 깊게 보면

유전체 육종가의 정확도는 참조 집단의 크기와 대상 개체와의 유전적 연관성에 달려 있어, 참조 집단이 작은 품종이나 참조 집단과 유전적으로 먼 개체에서는 정확도가 크게 떨어집니다. 한 품종에서 만든 예측식을 다른 품종에 적용하면 정확도가 거의 사라지는 것이 일반적입니다. 유전체 육종가도 추정치이므로 신뢰도가 함께 제시되어야 하며, 자손 성적으로 확인된 육종가와 같은 수준의 확실성을 갖는 것은 아닙니다. 참조 집단이 갱신되지 않으면 세대가 지날수록 정확도가 저하됩니다. 유전체 육종가는 SNP 칩으로 얻은 전체 유전체 정보와 참조 집단의 실측 성적을 연결해 추정하며, 참조 집단의 크기와 대상 집단과의 유전적 유사성이 정확도를 좌우합니다. 기존의 혈통 기반 육종가 추정과 달리 실제 유전체 정보를 직접 이용하기 때문에, 어린 개체라도 자신이나 후대의 성적이 나오기 전에 부모평균보다 정확도가 높은 육종가를 얻을 수 있다는 장점이 있습니다.

주의할 점

유전체육종가는 참조집단과 유전적 배경이 다른 집단에 적용하면 예측정확도가 크게 떨어질 수 있다.

참조 집단 규모가 작거나 대상 품종과 유전적 차이가 크면 추정 정확도가 낮아질 수 있다.

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