MOPS 완충액 (MOPS Buffer)
쉽게 풀면
RNA는 DNA보다 훨씬 불안정해서 실험 도중 쉽게 분해되는데, MOPS 완충액은 RNA 전기영동에서 이런 손상을 줄여주는 역할을 한다. 생체 시스템과 화학적으로 잘 반응하지 않는 특성 덕분에 세포 배양이나 효소 반응에서도 안정적인 pH 유지에 자주 쓰인다. 포름알데하이드 젤 전기영동처럼 RNA 크기를 확인하는 실험에서 표준적으로 사용되는 완충액이다. RNA 실험에 쓸 때는 RNA 분해효소가 없는 시약으로 만들어야 한다.
왜 중요한가
RNA 실험 결과의 신뢰도는 시작 단계에서 RNA가 얼마나 온전하게 보존되었는지에 크게 좌우되는데, MOPS 완충액은 RNA 분해를 최소화하면서 안정적인 pH를 유지해주기 때문에 노던 블롯, RNA 전기영동, 전사체 분석을 위한 시료 준비 과정에서 표준적으로 채택됩니다. 굿 완충제 계열답게 생체 성분과의 비특이적 반응이 적어, RNA 실험뿐 아니라 세포 배양이나 완충 조건이 민감한 생화학 실험에서도 두루 쓰입니다.
논문에서는 이렇게 쓰입니다
RNA의 무결성을 확인하기 위해 변성 조건의 전기영동을 수행했음을 설명하는 문장이다.
MOPS 완충액을 이용한 젤 분리 후 특정 유전자의 RNA 발현 수준을 검출했다는 뜻이다.
RNA 실험이 아닌 세포 배양 환경에서도 MOPS가 pH 완충 목적으로 쓰인 예다.
조금 더 깊게 보면
MOPS는 굿(Good) 완충제 계열에 속하는 완충 물질로, 이 계열은 생체 시스템에서 자주 쓰이는 금속 이온이나 효소와 비특이적으로 반응하는 경우가 적어 인산염 완충액 같은 전통적 완충제보다 실험 결과를 왜곡할 가능성이 낮다는 특징이 있습니다. RNA 전기영동에서는 대개 포름알데하이드나 글리옥살 같은 변성제와 함께 사용해 RNA의 이차구조를 풀어줌으로써 크기에 따라 정확하게 분리되도록 합니다. RNA는 극미량의 RNase에도 쉽게 분해되므로, MOPS 완충액 자체를 만들 때부터 RNase가 없는 물과 유리기구를 쓰는 것이 관례입니다.
주의할 점
RNA 실험용으로 만들 때는 RNase가 없는 물과 기구를 사용해야 결과가 왜곡되지 않는다.